Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRDCB7Z8K6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRDCB7Z8K6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms