Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB1P1B2RPK0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB1P1B2RPK0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms