Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms