Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C4orf47A7E2U8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf47A7E2U8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C4orf47A7E2U8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms