Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJE1A6NN92 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJE1A6NN92 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJE1A6NN92 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms