Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDR42E2A6NKP2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms