Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEMP2A6NFY4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEMP2A6NFY4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEMP2A6NFY4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms