Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3AA6NCI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWA3AA6NCI4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA3AA6NCI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms