Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms