Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SSPOA2VEC9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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