Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DENND3A2RUS2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND3A2RUS2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms