Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC66A2RUB6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC66A2RUB6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms