Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2F8A0AVK6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F8A0AVK6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms