Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC196A0A1B0GTZ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC196A0A1B0GTZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC196A0A1B0GTZ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC196A0A1B0GTZ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC196A0A1B0GTZ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms