Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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