Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0D9SFI3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms