Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP35Q9P2H5 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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