Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CALCOCO1Q9P1Z2 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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