Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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C9orf16Q9BUW7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
C9orf16Q9BUW7 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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