Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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GTF3C6Q969F1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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GTF3C6Q969F1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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GTF3C6Q969F1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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GTF3C6Q969F1 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF3C6Q969F1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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