Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms