Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms