Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC112Q8NEF3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms