Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CLIP4Q8N3C7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLIP4Q8N3C7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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