Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SCXQ7RTU7 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms