Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TDRD12Q587J7 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms