Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4721-201ENST00000577590 89 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC007923.3-201ENST00000578645 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4418-201ENST00000581169 62 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC002116.2-201ENST00000586962 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00663-207ENST00000590092 1023 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL359643.3-201ENST00000606761 1086 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL772337.4-201ENST00000610707 745 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 RHAG-203ENST00000618248 1203 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 NEAT1_1.1-201ENST00000620348 120 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GSTTP1-204ENST00000621179 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC061709.2-201ENST00000624053 898 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GALNTL6-204ENST00000508122 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CHMP2B-203ENST00000471660 2528 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM159-203ENST00000451578 1378 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL133245.1-201ENST00000608925 1365 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01103-201ENST00000430551 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC104758.3-204ENST00000567226 1493 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LST1-201ENST00000211921 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CINP-201ENST00000216756 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KIR2DL4-202ENST00000346587 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC073834.1-201ENST00000357045 590 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 APOM-202ENST00000375918 922 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SMIM21-201ENST00000382638 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP4-11-201ENST00000391413 1180 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-U-204ENST00000418981 186 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms