Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AP3B2Q13367 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms