Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms