Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPM4P67936 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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