Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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