Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRKCHP24723 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRKCHP24723 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRKCHP24723 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRKCHP24723 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRKCHP24723 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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