Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms