Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIG1P18858 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIG1P18858 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIG1P18858 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms