Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9Y3F1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9Y3F1 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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