Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CC2D2AQ9P2K1 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms