Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCDC88CQ9P219 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
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CCDC88CQ9P219 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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