Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FANCFQ9NPI8 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms