Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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