Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms