Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms