Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP34Q70CQ2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP34Q70CQ2 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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