Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCC8Q09428 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms