Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALD1Q05682 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms