Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP46P62068 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP46P62068 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP46P62068 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP46P62068 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP46P62068 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP46P62068 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP46P62068 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP46P62068 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
USP46P62068 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP46P62068 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP46P62068 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP46P62068 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP46P62068 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP46P62068 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP46P62068 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
USP46P62068 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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