Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms