Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMPOP42166 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms