Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms