Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms