Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYT1P21579 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYT1P21579 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYT1P21579 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYT1P21579 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms